Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms