Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OptnQ8K3K8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OptnQ8K3K8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms