Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c1Q8K284 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms