Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcf3Q8K268 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms