Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc4a8Q8JZR6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms