Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim61Q8JZK6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim61Q8JZK6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms