Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ercc8Q8CFD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ercc8Q8CFD5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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