Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc63Q8CDV6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms