Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc87Q8CDL9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms