Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Nhlrc3Q8CCH2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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