Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntrobQ8CB62 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntrobQ8CB62 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms