Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stbd1Q8C7E7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stbd1Q8C7E7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stbd1Q8C7E7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stbd1Q8C7E7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stbd1Q8C7E7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Stbd1Q8C7E7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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