Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7cQ8C6E1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms