Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms