Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms