Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx16Q8C080 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Snx16Q8C080 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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