Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trerf1Q8BXJ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms