Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms