Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

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Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp9Q8BTS3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gbp9Q8BTS3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gbp9Q8BTS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gbp9Q8BTS3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gbp9Q8BTS3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gbp9Q8BTS3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp9Q8BTS3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms