Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ap3s2Q8BSZ2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ap3s2Q8BSZ2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms