Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bicd1Q8BR07 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms