Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efemp1Q8BPB5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efemp1Q8BPB5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms