Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik4Q8BMF5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms