Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf18Q8BM39 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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