Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms