Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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