Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms