Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms