Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npm2Q80W85 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms