Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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