Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms