Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms