Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms