Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ScocQ78YZ6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ScocQ78YZ6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ScocQ78YZ6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ScocQ78YZ6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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