Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snd1Q78PY7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms