Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme8Q715T0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme8Q715T0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme8Q715T0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme8Q715T0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme8Q715T0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme8Q715T0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms