Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms