Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms