Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Atp8b3Q6UQ17 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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