Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja6Q6S5G4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms