Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms