Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms