Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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