Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvoplQ6PDF3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms