Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms