Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms