Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Herc4Q6PAV2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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