Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms