Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RbfaQ6P3B9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms