Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc3bQ6NWW9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms